Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PARP4Q9UKK3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms