Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms