Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP2Q9UDT6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms