Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD4AQ9P2Q2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms