Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms