Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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