Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms