Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KIAA1549Q9HCM3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms