Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCAF1Q9H7N4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF1Q9H7N4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms