Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN2Q9H4D0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms