Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms