Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms