Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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