Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms