Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms