Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms