Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms