Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL3Q9BXA9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms