Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms