Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms