Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms