Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC43Q96MW1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms