Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJD4Q96KN9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms