Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP47Q96K76 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms