Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms