Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF25Q93038 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF25Q93038 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms