Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms