Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRG4Q92954 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms