Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX54Q8TDD1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms