Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00116Q8NCU8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms