Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMGNT2Q8NAT1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms