Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD1Q8NA66 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms