Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC155Q8N6L0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms