Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC84Q86UT8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms