Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms