Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BLOC1S2Q6QNY1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S2Q6QNY1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms