Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC12Q6PEW1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms