Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD2Q6P5Q4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD2Q6P5Q4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD2Q6P5Q4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD2Q6P5Q4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD2Q6P5Q4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms