Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOGA3Q5TF21 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms