Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC183Q5T5S1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC183Q5T5S1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms