Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIVEP3Q5T1R4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms