Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF3Q5SZQ8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms