Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms