Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms