Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLE1Q53GS7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms