Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBK1Q52WX2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBK1Q52WX2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms