Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms