Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA9Q16790 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA9Q16790 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CA9Q16790 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CA9Q16790 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA9Q16790 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CA9Q16790 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CA9Q16790 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CA9Q16790 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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