Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN3Q16667 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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