Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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